Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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