Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pop5Q9DB28 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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Pop5Q9DB28 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Pop5Q9DB28 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pop5Q9DB28 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms