Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Exo5Q9CXP9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Exo5Q9CXP9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Exo5Q9CXP9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Exo5Q9CXP9 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Exo5Q9CXP9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Exo5Q9CXP9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Exo5Q9CXP9 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Exo5Q9CXP9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Exo5Q9CXP9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Exo5Q9CXP9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Exo5Q9CXP9 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms