Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fcf1Q9CTH6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fcf1Q9CTH6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms