Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup155Q99P88 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup155Q99P88 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 328.7 ms