Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hps4Q99KG7 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
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