Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Dok4Q99KE3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms