Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc115Q8VE99 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms