Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Dnajc28Q8VCE1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dnajc28Q8VCE1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Dnajc28Q8VCE1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Dnajc28Q8VCE1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Dnajc28Q8VCE1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Dnajc28Q8VCE1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Dnajc28Q8VCE1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Dnajc28Q8VCE1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Dnajc28Q8VCE1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dnajc28Q8VCE1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dnajc28Q8VCE1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dnajc28Q8VCE1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dnajc28Q8VCE1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dnajc28Q8VCE1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Dnajc28Q8VCE1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Dnajc28Q8VCE1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Dnajc28Q8VCE1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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