Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5C8

Rdh9, Cis-retinol/androgen dehydrogenase type 3, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh9Q8K5C8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rdh9Q8K5C8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms