Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Csnka2ipQ8CH19 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms