Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Klf17Q8CFA7 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Klf17Q8CFA7 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Klf17Q8CFA7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Klf17Q8CFA7 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Klf17Q8CFA7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Klf17Q8CFA7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Klf17Q8CFA7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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