Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc30Q8BVF4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc30Q8BVF4 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc30Q8BVF4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc30Q8BVF4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc30Q8BVF4 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc30Q8BVF4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc30Q8BVF4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc30Q8BVF4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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