Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Atg4bQ8BGE6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Atg4bQ8BGE6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Atg4bQ8BGE6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Atg4bQ8BGE6 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms