Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NischQ80TM9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
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