Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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