Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed3Q78IS1 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed3Q78IS1 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms