Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC8.82□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
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NipblQ6KCD5 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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NipblQ6KCD5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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NipblQ6KCD5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC8.81□□□□□ -1
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