Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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