Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sall3Q62255 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms