Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Urb1Q571H0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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