Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Snx33Q4VAA7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Snx33Q4VAA7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Snx33Q4VAA7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Snx33Q4VAA7 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Snx33Q4VAA7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Snx33Q4VAA7 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Snx33Q4VAA7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snx33Q4VAA7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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