Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms