Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms