Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hddc2Q3SXD3 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.4 ms