Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms