Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cdx4Q07424 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms