Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah1bQ06985 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms