Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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