Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pfdn6Q03958 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pfdn6Q03958 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pfdn6Q03958 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pfdn6Q03958 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pfdn6Q03958 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pfdn6Q03958 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pfdn6Q03958 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pfdn6Q03958 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pfdn6Q03958 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pfdn6Q03958 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pfdn6Q03958 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pfdn6Q03958 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pfdn6Q03958 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Pfdn6Q03958 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pfdn6Q03958 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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