Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec23aQ01405 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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