Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax8Q00288 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax8Q00288 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms