Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms