Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Arf1P84078 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Arf1P84078 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Arf1P84078 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms