Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tp53bp1P70399 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tp53bp1P70399 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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