Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SbdsP70122 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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