Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps3P62908 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms