Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Fgf1P61148 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Fgf1P61148 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Fgf1P61148 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Fgf1P61148 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Fgf1P61148 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Fgf1P61148 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Fgf1P61148 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Fgf1P61148 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Fgf1P61148 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Fgf1P61148 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Fgf1P61148 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fgf1P61148 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms