Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TgfaP48030 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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