Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Pax9P47242 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax9P47242 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Pax9P47242 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms