Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtgfrP43117 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms