Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Tnfsf9P41274 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf9P41274 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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