Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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