Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NapbP28663 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NapbP28663 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NapbP28663 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms