Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TP20293 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TP20293 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TP20293 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms