Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CtsdP18242 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CtsdP18242 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CtsdP18242 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CtsdP18242 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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