Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa-rs1P17533 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa-rs1P17533 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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