Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
OtcP11725 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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OtcP11725 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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OtcP11725 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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OtcP11725 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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OtcP11725 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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OtcP11725 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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OtcP11725 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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OtcP11725 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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OtcP11725 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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OtcP11725 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
OtcP11725 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
OtcP11725 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms