Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01735 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01735 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01735 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01735 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01735 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01735 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01735 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01735 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms