Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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DffaO54786 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
DffaO54786 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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DffaO54786 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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DffaO54786 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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DffaO54786 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
DffaO54786 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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